單方「胡黃連」以其清熱利濕之效，歷代醫家多有論述。其功效，從古代本草典籍中可窺見一斑。

《新修本草》記載胡黃連能「主骨蒸勞熱，補肝膽，明目」，此處「骨蒸勞熱」多指陰虛內熱之症，胡黃連能清熱，同時又能兼顧肝膽之虛弱，說明其清熱不傷陰，兼具滋補作用。此外，其治「冷熱洩痢」則展現了其清熱利濕的功效，洩痢本屬濕熱之症，胡黃連正可對症下藥。

《開寶本草》進一步闡述其功效，指出胡黃連可治「久痢成疳，傷寒咳嗽，溫瘧，骨熱」，這些病症都與濕熱、邪熱有關。 「理腰腎，去陰汗」則顯示胡黃連可能具有溫補腎陽，調節陰陽平衡的作用，這與《新修本草》中提及的補肝膽，可能存在某種關聯性。 此外，其能治「小兒驚癇，寒熱，不下食，霍亂下痢」，說明其應用範圍廣泛，涵蓋了小兒及成人，不同證型的濕熱、邪熱病症。

《丹溪心法》則單獨指出胡黃連能「去果子積」，這點說明胡黃連可能具有消食導滯的功效，可能與其清熱利濕作用相關，因積滯也會導致濕熱內生。

《本草正》更進一步說明其能「治吐血、衄血」，這與其清熱涼血之效相符，說明胡黃連清熱的功效，能有效控制因熱邪導致的出血症狀。

綜上所述，胡黃連的清熱利濕功效，不僅體現在其治療洩痢、骨蒸勞熱等明顯濕熱證，更在治療其他相關病症中有所體現，例如傷寒、溫瘧等熱病，以及因濕熱導致的積滯、出血等病症。 其清熱作用並非單純的瀉火，而是兼顧了滋陰、補腎、消食等多方面作用，是一味兼具清熱利濕和某些補益功效的中藥。

胡黃連其抗發炎功效源於所含多種生物鹼、黃酮、蒼朮素等複雜活性成分的協同作用。其核心機制在於多靶點調控發炎通路。特別是其主要成分小蘗鹼（berberine），能顯著抑制NF-κB（核因子κB）信號通路的激活，進而減少腫瘤壞死因子-α（TNF-α）、介白素-1β（IL-1β）、介白素-6（IL-6）等促炎細胞因子的產生與釋放。同時，亦能調控環氧合酶-2（COX-2）和誘導型一氧化氮合酶（iNOS）的表達，降低前列腺素和一氧化氮等關鍵炎症介質的生成。這些作用解釋了其在風濕性關節炎、牙周炎、皮膚炎等病症中的抗炎功效，透過抑制關節滑膜炎、牙周組織破壞及皮膚紅腫熱痛等炎症反應，達到緩解症狀的目的。胡黃連的抗炎作用廣泛，不僅限於抑制急性炎症，對慢性炎症的調控亦展現潛在效益，同時常伴隨抗氧化壓力與免疫調節能力。