中藥食茱萸主治溫中、燥濕、殺蟲、止痛。治心腹冷痛，寒飲，洩瀉，冷痢，濕痹，赤白帶下，齒痛。

• 《藥性論》："治冷痹腰腳軟弱，通身刺痛，腸風痔疾，殺腸中三蟲，去虛冷。"
• 《千金·食治》："止痛下氣，除咳逆，去五臟中寒冷，溫中，諸冷實不消。"
• 《唐本草》："功用與吳茱萸同，少為劣耳，療水氣用之乃佳。"
• 《食療本草》："主心腹冷氣痛，中惡，除飲逆，又齒痛酒煎含之。"
• 《本草拾遺》："治惡血毒，起陽，殺牙齒蟲痛。"
• 《綱目》："治冷痢帶下，暖胃燥濕。"
• 《重慶堂隨筆》："少食能疏風秘。"

現代研究表明，食茱萸具有抗菌、抗炎、鎮痛、抗氧化、降血糖、降血脂、抗腫瘤等作用。

• 抗菌作用 食茱萸水煎液對金黃色葡萄球菌、大腸桿菌、綠膿桿菌、痢疾桿菌等多種細菌有抑制作用。
• 抗炎作用 食茱萸水煎液對小鼠棉球肉芽腫有抑制作用。
• 鎮痛作用 食茱萸水煎液對小鼠扭體反應有鎮痛作用。
• 抗氧化作用 食茱萸水煎液具有清除自由基、抑制脂質過氧化的作用。
• 降血糖作用 食茱萸水煎液能降低四氧嘧啶所致的糖尿病小鼠的血糖水平。
• 降血脂作用 食茱萸水煎液能降低高脂血症小鼠的血清總膽固醇、三酰甘油、低密度脂蛋白膽固醇水平。
• 抗腫瘤作用 食茱萸水煎液能抑制小鼠艾氏腹水癌細胞的生長。

食茱萸具有多種藥理作用，但其毒性較大，臨床應用時應慎重。

內服：煎湯，0.5～1錢；或入丸、散。外用：搗敷或煎水洗。