阿魏單方治瘧的功效，古籍記載並非明確主治，而是透過其多樣藥性間接推論。其治瘧功效主要見於《日華子本草》：「治瘧」，及《本草綱目》引述《百一選方》中，以阿魏配丹砂治療瘧疾的案例。

多數古籍記載阿魏的藥性偏向於破積消滯、殺蟲解毒。如《本草匯言》提到阿魏「化積、墮胎、殺蟲」，能消解食物積滯；《新修本草》則記載其「殺諸小蟲，去臭氣，破症積，下惡氣」；《神農本草經疏》更指出其「善殺諸蟲，專闢惡氣」，並認為其辛溫之性能「消積，利諸竅，除穢惡」。《本草通玄》也提到阿魏能「截瘧，止痢，解毒，止臭」。

這些記載說明阿魏具有驅除體內邪氣、消除積滯的作用。而古人認為瘧疾的發生，部分與體內積滯、邪氣有關，因此阿魏的這些功效，間接地被運用於治療瘧疾。例如，《本草綱目》中提到的阿魏丹砂方，便是透過阿魏的消積解毒作用，輔以丹砂的特殊功效，來達到治療瘧疾的目的。

值得注意的是，《百一選方》中的阿魏丹砂方僅為單一案例，且阿魏治療瘧疾的記載相對較少，並非其主要功效。 因此，單純依靠阿魏治療瘧疾的療效，仍需謹慎看待，應參考更多醫學文獻及專業醫師的意見。

阿魏所含揮發油，富含香豆素、巴豆酸、茴香酮等多種芳香烴類物質。現代藥理研究證實，這些活性成分具顯著廣譜抗菌效應，能有效抑制金黃色葡萄球菌、鏈球菌等多種革蘭氏陽性與陰性細菌，及部分真菌的生長繁殖，作用機制涉及破壞病原體細胞膜、幹擾其代謝。針對抗病毒方面，初步研究顯示其提取物對某些病毒如流感病毒、皰疹病毒具有潛在抑制作用，可能透過影響病毒吸附或複製週期發揮作用，但相關機制及臨床應用仍需更多深入研究證明。