主治功效
外感風寒，發熱自汗，微惡寒，或寒熱往來，鼻鳴乾嘔，頭痛項強，胸脅痛滿，脈弦或浮大。 現用於感冒、癲癇、流行性出血、流感、胰腺炎、急慢性胃炎、慢性肝炎、膽結石、癲癇、肋間神經痛、胃、十二指腸潰瘍、瘧疾、神經痛。
- 精神、神經系統：日本醫學家善用本方治療癲癇，並取得良好效果。在臨床發現癲癇患者多有胸脅苦滿、腹肌痙攣等症狀，應用超聲波診斷技術對癲癇患者進行服藥前後對照觀察，發現內服柴胡桂枝湯可使癲病患者的腦電波改善。本方對學齡前期、學齡期及青年期患者的效果更好，且對小兒的智力亦有一定的提高。此外對於自律神經失調、神經衰弱、失眠、精神官能症、耳鳴、精神分裂症、憂鬱症等亦有效果。
- 消化系統：柴胡桂枝湯可治療消化性潰瘍疾病，預防消化性潰瘍復發，對慢性胃炎、胃下垂、慢性胰腺炎、慢性肝膽疾病、膽襄炎、膽石症、肝炎、胰腺炎、胸膜炎、肋間神經痛、眩暈證、肋軟骨炎有一定療效，其中以肝膽疾病為多。有學者用本方加減治療慢性胰腺炎患者，獲得良好療效。
- 循環系統：有學者運用柴胡桂枝湯加減治療多種心律失常、胸痛、心絞痛，效果良好。
- 呼吸系統：醫家運用用柴胡桂枝湯加減治療感冒、流感、小兒扁桃腺炎、老年性慢性支氣管炎等，均取得較好療效。針對纏綿難愈之感冒合併證，例如：眩暈、嘔吐、感冒周餘胃痛、滿悶不思飲食、感冒十餘日全身酸痛關節痛甚等病癥，用本方加減，均收效滿意。
- 婦女更年期綜合症：應用柴胡桂枝湯治療婦女更年期出現的自覺燥熱面赤、頭痛、肩酸痛、疲乏倦怠感、食欲減退等證候者，可取得較滿意的效果。有學者指出，柴胡桂枝湯是植物神經紊亂症的有效方。若患有頭痛燥熱、面部潮紅、煩躁出汗、汗出以後面色蒼白、畏寒等證，應用本方常有效。此外，本方對婦女經前期緊張症亦有較好療效。
- 其它：一些醫家運用此方加減治療過敏性紫瘢、夜半盜汗、急性腎炎、急性胃炎、急性泌尿系統感染、各種發熱性疾病、面癱、失眠、坐骨神經痛、腹痛發熱、無名高熱及多囊腎，均獲顯著療效。
傳統服藥法
柴胡 15 桂枝 10 薑半夏10 黃芩 10 黨參 10 白芍 10 甘草 5生薑 10 紅棗 10
方劑組成解釋
白芍性苦、酸、微寒。主治平肝止痛、斂陰止汗、養血和營。治療月經不調、經行腹痛、崩漏、自汗、盜汗、脅肋脘腹疼痛、四肢攣痛、頭痛、眩暈等症。
桂枝性辛甘溫、主治發汗解表、調和營衞、溫經通脈止痛、助心陽且通陽利水、常用於治療風寒感冒。
甘草性甘、平。主治補脾益氣、清熱解毒、祛痰止咳、緩急止痛、調和諸藥。用於脾胃虛弱、倦怠乏力、心悸氣短、咳嗽痰多、四肢攣急疼痛、癰腫瘡毒、緩解藥物毒性、烈性。
生薑性味辛、溫。主治主風寒感冒、惡寒發熱、頭痛鼻塞、嘔吐、痰飲喘咳、脹滿、泄瀉。
大棗性甘、溫。主治補中益氣、解藥毒、養血安神。用於脾虛食少、乏力便溏、婦人臟躁、氣管炎、腸炎、痢疾、崩漏、外用治外傷出血。
半夏性味辛、溫。主治降逆止嘔，燥濕化痰、降逆止嘔、消痞散結。用於痰多咳喘、痰飲眩悸、風痰眩暈、嘔吐反胃、胸脘痞悶、梅核氣。
柴胡性味苦、辛、微寒。主治解表退熱、疏肝解鬱、升舉陽氣。用於外感發熱、半表半裏寒熱往來、瘧疾、肝鬱脅痛乳脹、頭痛頭眩、月經不調、氣虛下陷之脫肛、子宮脫垂、胃下垂等症。
黃芩性味苦、寒。主治清熱燥濕、瀉火解毒、涼血止血、除熱安胎。用於肺熱咳嗽、熱病高熱神昏、肝火頭痛、目赤腫痛、濕熱黃疸、瀉痢；熱淋；吐衄血；崩漏；胎熱不安；癰腫疔瘡
人參性甘、微苦、微溫。主治大補元氣、復脈固脫、補脾益肺、生津、安神。用於體虛欲脫、肢冷脈微、脾虛食少、肺虛喘咳、津傷口渴、內熱消渴、久病虛羸、驚悸失眠、陽痿宮冷、心力衰竭、心原性休克。
本方取小柴胡湯、桂枝湯各半合劑而成。用桂枝湯調和營衛、解肌辛散，以解太陽之表；用小柴胡湯和解少陽、暢達樞機，以治半表半里。因證情不重，用藥劑量也較輕，故屬太少表裡雙解之輕劑，猶有未盡者。
柴胡桂枝湯的運用時機，主要出自於以下《傷寒論》條文：「傷寒六、七日，發熱、微惡寒、支節煩痛、微嘔、心下支結、外證未去者，柴胡桂枝湯主之。」(146)
傷寒六七日，發熱、微惡寒、四肢關節疼痛，可見太陽表證尚未被治癒，同時又見輕微嘔吐，感到胸脅悶、胃脘部悶，這是少陽病證巳見，膽熱犯胃，少陽經氣不利。因此，本證是比較典型的太陽少陽並病，治宜採用太陽、少陽兼顧的方法。
從原文中，微惡寒，可知發熱亦微，只有四肢疼痛，而沒有頭痛、脖子痛及全身痛，說明太陽表邪已輕。輕微噁心想吐、胸脅悶，可見雖然有少陽證卻不嚴重。所以不論太陽、少陽都不嚴重，用桂枝湯原劑之半治太陽，小柴胡湯原劑之半治少陽，合成柴胡桂枝湯。
《傷寒論〉原文101條提出：「傷寒中風，有柴胡證，但見一證便是，不必悉具。」在實務判別上，患者雖然已經有小柴胡湯的噁心嘔吐、胸脅肋間滿悶，但是病情較輕。而發熱微惡寒、四肢關節疼痛，雖然不嚴重，卻是明顯的太陽表證，所以應該考慮表裡兼顧的方法。
用柴胡桂枝湯既治少陽又治太陽，雙解太少表裡之邪，所以又稱「少陽兼表證」或「太陽少陽並病」。這種治法不僅符合「有柴胡證，但見一證便是，不必悉具」的理論，更符合表裡先後的原則，是一種比較周全的治療方法。
更簡單的解釋是，如果太陽病桂枝湯證不嚴重，卻開始出現一點點小柴胡湯證，就可以運用此方。現代應用發現背部不明原因發冷且四肢發涼時，運用此方效果也很好。