1生氣通天論
邪既陷入，留連不解，肉腠之間，瘡瘻生焉。瘻者，瘰癧之類也。瘻音漏。）俞氣化薄，傳為善畏，及為驚駭。（按：俞，背穴也。陽邪中人，多由背入，既入於俞，氣即汗漫，猝走經絡，薾然而畏，惕然而驚矣。所以者何？正為邪觸也。氣宜兼寒熱言，注單作寒解，偏矣。
俞音輸。）營氣不從，逆於肉理，乃生癰腫。（營逆則血鬱，血鬱則熱聚為癰腫也。）魄汗未盡，形弱而氣爍，穴俞以閉，發為風瘧。（按：汗何以言魄？魄藏於肺，汗出於玄府。玄府者，皮毛也。皮毛者，肺之合也。故云魄汗。未盡者，汗出不已，病之自汗者也。自汗不止，形自弱而氣自爍矣。
形氣大虛，風邪易入，正虧邪陷，不能外達，至秋而發，病因於風，則為風瘧也。故下文即云：）故風者，百病之始也。清淨則肉腠閉拒，雖有大風苛毒，弗之能害，此因時之序也。（……按：善入而人不知者，風也。諸邪病人，惟風為最。清淨以下，與前第二節辭義大同小異，不過反復言之，以見人能清淨則邪自不犯，無甚深意。注乃遠引別篇，曲為之解，其辭費哉。
）
故陽蓄積，病死，而陽氣當隔，隔者當瀉，不亟正治，粗乃敗之。（言三陽蓄積，怫結不通，不急瀉之，亦病而死。何者？蓄積不已，亦上下不並矣。何以驗之？隔塞不便，則其證也。若不急瀉，粗工輕侮，必見敗亡也。此節言三陽實證，乃陽之亢者，治宜攻下者也，皆由不善調養之所致。蓋陽外泄則病虛，陽蓄積則病實，是故貴得其平也。）
故陽氣者，（一日而主外。晝則陽氣在外，靈樞曰，「目開則氣上行於頭」，「衛氣行陽二十五度」也。）平旦人氣生，日中而陽氣隆，日西而陽氣已虛，氣門乃閉。（按：生者氣長漸盛，隆則盛之極也。閉非閉絕不通，謂去陽經而入陰分，猶分門而別戶也。注以氣門為玄府，誤矣。
）是故暮而收拒，無擾筋骨，無見霧露，反此三時，形乃困薄。（皆所以順陽氣也。陽出則出，陽藏則藏。暮，陽氣衰，內行陰分，故宜收斂以拒虛邪。按：反此三時，注單指收拒三句，非。宜頂上節言，謂平旦與日中，氣行於陽，可動則動；日西氣行於陰，當靜則靜。如動靜乖違，與時相反，則氣弱而形壞也。
）
陰者藏精而起亟也，陽者衛外而為固也。（按：通篇專重陽氣，故此節以前，單發陽之所繫至重，而此節以後，則平論陰陽，以見陽之不可無陰，亦猶陰之不可無陽也。陰陽互根之理，正天地合德之妙，變化所由起，萬物所由成，順之則得其所，逆之則疾病生，為篇中一大關鍵，而注反略而不解，真未達岐黃要旨者也。亟，注作數解，殊無意味。
按字書，亟，一切吉逆，亦切去吏，其音為氣，因其音而推其義，疑即氣字之訛也。蓋陽主外，陰主內，陽衛外，陰藏精，合之後篇，言氣歸精，又言精化為氣，則知陽根於陰，而陰實為起氣者也。臆解存正。亟，去聲。）陰不勝其陽，則脈流薄疾，並乃狂；陽不勝其陰，則五臟氣爭，九竅不通。
《生氣通天論》：
當病邪侵入人體並滯留不去時，會在肌肉紋理間形成瘡瘻（類似瘰癧的病症）。若邪氣從背部穴位深入，會導致氣血運行紊亂，引發恐懼、驚嚇等症狀（因陽邪多由背部入侵，擾亂經絡氣血）。營氣運行不暢，逆亂於肌肉組織，便會形成癰腫（營氣逆亂導致血瘀，瘀久化熱而成膿腫）。若汗出未止（肺主皮毛，汗孔開洩過度），形體虛弱而氣血耗損，腧穴閉塞，則易發風瘧（自汗不止致正氣虛，風邪乘虛內陷，至秋季發病）。因此，風邪是百病之源。若人體保持清淨（氣血調和），則肌表堅固，即使遭遇強風或劇毒也難以侵害，這是順應自然規律的結果。
若陽氣過度蓄積（如三陽經氣鬱結不通），不及時疏通則可能致命（症狀如隔塞不通）。此時需急瀉實邪，若延誤治療或醫者輕率處理，將導致病情惡化（此段強調陽氣亢盛的實證需攻下治療，關鍵在於調節平衡）。
陽氣在一天中的變化：清晨開始生發，正午最旺盛，日落後漸衰，汗孔隨之閉合（「氣門」指陽氣由表入裏的轉換通道，非單指毛孔）。因此夜晚應收斂活動，避免勞累筋骨或暴露於霧露（違背此作息規律會損傷形體）。
陰陽相互依存：陰藏精而化生氣（「起亟」或為「起氣」之誤，指陰精化生陽氣），陽護衛體表而固守於外。若陰不制陽，會使血脈急迫甚至發狂；陽不制陰則五臟功能失調，九竅不通（強調陰陽失衡的病理表現）。此段為全文關鍵，闡明陰陽互根之理，但古代注釋未充分解讀。