1傷寒緒論卷上
發汗則濕熱混合為一，而中氣盡傷，多成死證，惟宜分解先扶中氣，
使中氣徐領其表其裏，而上下盡消，故多愈也，至於疫證，則邪正混合，邪極勝，
正極衰，轉眼立斃，苦寒傷胃，溫補助邪，如人中黃丸之類，不為合法也，
夫傷寒之邪，先行身之背，次行身之前，後行身之側，由外廓而入瘟疫之邪，
則直行中道，流布三焦，上焦為清陽，故清邪從之上，入下焦為濁陰，
故濁邪從之下入，中焦為陰陽交界，凡清濁之邪，必有此區分，
甚者三焦相混上行極而下下行而上，傷寒邪中外廓，故一表即散邪行在中道，
故表之不散，傷寒邪入胃府，則腹滿便堅，故可攻下疫邪布，
在中焦散漫不收下之復合，此與治傷寒表裏諸法有何涉哉，或問春夏蒸氣成疫，
豈冬溫獨非疫耶，蓋冬月過溫腎氣不藏，感而成病正與不藏精之春溫無異，
計此時有春無冬，三氣即得交蒸成疫，然遇朔風驟發，則蒸氣化為烏有矣，
是以東南冬月患正傷寒者少，患冬溫及痘瘡者最多，西北則秋冬春皆患傷寒，
殊無瘟疫痘瘡之患，此何以故西北土地高燥即春夏氣難上升，
何況秋冬之凝沍東南土地卑濕，為霧露之區，蛇龍之窟，其濕熱之氣，
得風播之尚有可耐，旦暮無風水中之魚，衣中之虱，且為飛揚，況於人乎，
蒸氣中原雜諸穢，益以病氣屍氣，無分老少，觸之即同一病狀矣此時朔風，
了不可得故其氣轉積轉暴，雖有薰風，但能送熱，不能涼，盛世所謂解慍阜財者，
在兵荒反有注邪佈穢之事矣。按吳又可所論，皆是尋常所有疫癘，喻嘉言所言，
乃天地不正之大疫，不可彼此膠執也，夫瘟疫證類端，豈可一律而論，
若傷於氣則頭項腫脹，傷於血則肢體疙C5，傷於胃則嘔汁如血，
傷於腸則水泄不通，至入藏則不知，人不待救藥則斃矣，大法以證為則，無以脈胗，
其傷之輕者，二三日尚能行動，至四五日後，忽然大熱，慎勿誤認傷寒，
而與表藥發汗，不惟不解，其熱轉甚而危殆矣，其初病惡寒發熱頭痛，
宜敗毒散躁熱不汗，通解頭痛如破，十神湯，兼瘴癘腳膝疼軟，獨活散，
此皆為表證多者立方也，若一病便壯熱無寒，多汗神昏嘔逆痞滿等證，
又當從涼膈雙解，三黃石膏黃連解毒，兩解表裏法治之，古人以普濟消毒飲，
治大頭瘟，荊防毒散治捻頸瘟，生犀飲治瓜瓤瘟，清熱解湯下人中黃丸，
併刺塊出血，治楊梅瘟三稜鍼刺入委中三分出血及服人中黃散，治疙C5瘟，
蒼朮白虎湯，治軟腳瘟，雙解散探吐，治絞腸瘟，此皆昔人已驗之方，
足補仲景之未逮也。凡時疫流行之際，小兒亦多傳染，
傷寒例所謂小兒女子益以滋甚，以小兒筋骨柔脆，一染時疫，即驚搐發痙，
誤作驚治必死，治稍遲延亦死，其治與大人彷彿，但幼科專於痘疹驚疳，而傷甚略，
《傷寒緒論卷上》：
發汗會導致濕熱混合，損傷中氣，容易造成死亡，應該先分解濕熱，扶持中氣，讓中氣慢慢調和表裡，使病邪消散，這樣多能痊癒。至於瘟疫，邪氣強盛而正氣極度衰弱，病情危急，使用苦寒藥會傷胃，溫補藥反而助長邪氣，像人中黃丸這類方劑並不適合。
傷寒的邪氣先侵犯背部，再蔓延到身體前面，最後到側面，由外往內侵入；而瘟疫的邪氣則直接侵犯中焦，擴散到三焦。上焦屬清陽，清邪從上侵入；下焦屬濁陰，濁邪從下侵入；中焦是陰陽交界，清濁邪氣在此區分。嚴重時，三焦混亂，邪氣上下流竄。傷寒邪氣在體表，發汗即可消散；瘟疫邪氣在中焦，發汗無效。傷寒邪入胃腑會腹脹便秘，可用攻下法治療；瘟疫邪氣散佈中焦，難以收束，攻下後又會復發，與治療傷寒的表裡方法不同。
有人問：春夏濕熱蒸騰形成瘟疫，難道冬天溫暖就不會引發瘟疫嗎？其實冬天過暖會導致腎氣不固，感染後發病與春天溫病類似。如果冬季氣候像春天，濕熱交蒸也可能形成瘟疫，但若遇到寒風突然來襲，濕熱之氣就會消散。因此，東南地區冬季患傷寒的少，患冬溫和痘瘡的多；西北地區秋冬春三季多傷寒，少有瘟疫和痘瘡。這是因為西北地勢高燥，濕熱難以上升；東南地勢低濕，霧露多，濕熱之氣隨風散播，若無風，濕熱更易滯留，加上病氣、屍氣混雜，人一旦感染，不分老少，症狀相同。此時若無寒風，邪氣積聚更猛，即使有風也只會助熱，無法降溫。
吳又可討論的是常見的瘟疫，喻嘉言則指天地間異常的大疫，兩者不可混為一談。瘟疫症狀多樣，不能一概而論：傷於氣則頭頸腫脹，傷於血則肢體生瘡，傷於胃則嘔吐如血，傷於腸則腹瀉不止，若邪入臟腑則昏迷不醒，不及救治就會死亡。治療應以症狀為準，不必拘泥脈象。輕症者兩三天還能活動，四五天後突然高燒，切勿誤認傷寒而用發汗藥，否則熱勢更重，病情危殆。初期惡寒發熱頭痛，可用敗毒散；煩躁無汗、頭痛劇烈用十神湯；兼有瘴氣腳膝酸軟用獨活散，這些都是針對表證較多的方劑。若一開始就高燒無寒、多汗神昏、嘔吐腹脹，則需用涼膈散、雙解散、三黃石膏湯、黃連解毒湯等表裡雙解的治法。
古人用普濟消毒飲治大頭瘟，荊防敗毒散治捻頸瘟，生犀飲治瓜瓤瘟，清熱解毒湯送服人中黃丸並刺血塊治楊梅瘟，三稜針刺委中穴出血並服人中黃散治疙瘩瘟，蒼朮白虎湯治軟腳瘟，雙解散催吐治絞腸瘟，這些都是前人驗證有效的方劑，可補張仲景學說的不足。
瘟疫流行時，小孩也易感染。傷寒論提到小兒和婦女病情更重，因為小兒筋骨脆弱，感染後易驚厥抽搐，誤當驚風治療必死，延誤治療也會死亡。治法與成人相似，但兒科多專注於痘疹驚疳，對傷寒瘟疫較少著墨。