1真陰論
精藏於此，精即陰中之水也；氣化於此，氣即陰中之火也。命門居兩腎之中，即人身之太極，由太極以生兩儀，而水火具焉，消長系焉，故為受生之初，為性命之本。欲治真陰而捨命門，非其治也，此真陰之臟，不可不察也。所謂真陰之用者，凡水火之功，缺一不可。命門之火，謂之元氣；命門之水，謂之元精。
五液充，則形體賴而強壯；五氣治，則營衛賴以和調。此命門之水火，即十二臟之化源。故心賴之，則君主以明；肺賴之，則治節以行；脾胃賴之，濟倉廩之富；肝膽賴之，資謀慮之本；膀胱賴之，則三焦氣化；大小腸賴之，則傳導自分。此雖云腎臟之伎巧，而實皆真陰之用，不可不察也。
所謂真陰之病者，凡陰氣本無有餘，陰病惟皆不足。即如陰勝於下者，原非陰盛，以命門之火衰也；陽勝於標者，原非陽盛，以命門之水虧也。水虧其源，則陰虛之病疊出；火衰其本，則陽虛之證迭生。如戴陽者，面赤如朱；格陽者，外熱如火。或口渴咽焦，每引水以自救；或躁擾狂越，每欲臥於泥中。
或五心煩熱而消癉骨蒸，或二便秘結而溺漿如汁。或為吐血衄血，或為咳嗽遺精。或斑黃無汗者，由津液之枯涸；或中風瘛瘲者，以精血之敗傷。凡此之類，有屬無根之焰，有因火不歸原，是皆陰不足以配陽，病在陰中之水也。
又如火虧於下，則陽衰於上，或為神氣之昏沉，或為動履之困倦，其有頭目眩暈而七竅偏廢者，有咽喉哽咽而嘔惡氣短者，皆上焦之陽虛也；有飲食不化而吞酸反胃者，有痞滿隔塞而水泛為痰者，皆中焦之陽虛也；有清濁不分而腸鳴滑泄者，有陽痿精寒而臍腹多痛者，皆下焦之陽虛也。
又或畏寒洒洒者，以火臟之陽虛，不能禦寒也；或肌肉臌脹者，以土臟之陽虛，不能制水也；或拘攣痛痹者，以木臟之陽虛，不能營筋也；或寒嗽虛喘，身涼自汗者，以金臟之陽虛，不能保肺也；或精遺血泄，二便失禁，腰脊如折，骨痛之極者，以水臟之陽虛，精髓內竭也。凡此之類，或以陰強之反克，或由元氣之被傷，皆陽不足以勝陰，病在陰中之火也。
王太僕曰：寒之不寒，責其無水；熱之不熱，責其無火。無火無水，皆在命門，總曰陰虛之病，不可不察也。所謂真陰之治者，凡亂有所由起，病有所由生，故治病必當求本。蓋五臟之本，本在命門，神氣之本，本在元精，此即真陰之謂也。王太僕曰：壯水之主，以制陽光；益火之源，以消陰翳。
正此謂也。許學士曰：補脾不如補腎。亦此謂也。近惟我明薛立齋，獨得其妙，而常用仲景八味丸，即益火之劑也；錢氏六味丸，即壯水之劑也。每以濟人，多收奇效，誠然善矣；第真陰既虛，則不宜再泄，二方俱用茯苓澤瀉，滲利太過，即仲景金匱，亦為利水而設，雖曰於大補之中，加此何害，然未免減去補力，而奏功為難矣。
真陰論
精藏於此處，精就是陰中的水；氣在此處化生，氣就是陰中的火。命門位於兩腎之間，是人體的太極，從太極生出陰陽兩儀，水火由此具備，消長變化也與此相關，因此命門是生命的起始，也是性命的根本。若要調治真陰卻忽略命門，就不是正確的治療方法，這真陰所在的臟腑，不可不仔細觀察。
所謂真陰的作用，凡是水火的功效，缺一不可。命門的火，稱為元氣；命門的水，稱為元精。五液充足，則形體得以強健；五氣調和，則營衛得以協調。命門的水火，就是十二臟腑變化的根源。因此，心依賴它，君主（心神）才能清明；肺依賴它，治理調節的功能才能運行；脾胃依賴它，才能充實倉廩（消化吸收）；肝膽依賴它，才能提供謀慮的根本；膀胱依賴它，三焦的氣化才能正常；大小腸依賴它，傳導功能才能自行運作。這些雖然看似是腎臟的技巧，但實際上都是真陰的作用，不可不察。
所謂真陰的病變，凡是陰氣本來就不會有過剩的情況，陰病都是不足所致。例如陰氣在下過盛，其實並非陰氣旺盛，而是命門的火衰弱；陽氣在表面過盛，也不是陽氣旺盛，而是命門的水不足。水源虧損，則陰虛之病接連出現；火源衰弱，則陽虛之證不斷發生。例如戴陽證，面色赤紅如朱；格陽證，體表發熱如火。或口渴咽乾，常想喝水自救；或煩躁狂亂，甚至想臥於泥中。
或五心煩熱，消瘦骨蒸；或大小便秘結，尿液濃稠如汁。或吐血、鼻血，或咳嗽、遺精。或皮膚斑黃無汗，是因津液枯竭；或中風抽搐，是因精血損傷。這些症狀，有的是無根之火，有的是火不歸原，都是陰不足以配陽，病在陰中之水。
又如火虧於下，則陽衰於上，可能表現為神志昏沈，或行動睏倦。有的頭暈目眩，七竅功能衰退；有的咽喉阻塞，嘔吐氣短，這些都是上焦陽虛的表現。有的飲食不化，吞酸反胃；有的胸腹脹滿，水泛為痰，這些都是中焦陽虛的表現。有的清濁不分，腸鳴腹瀉；有的陽痿精冷，臍腹疼痛，這些都是下焦陽虛的表現。
還有的畏寒發抖，是因火臟（心）陽虛，不能禦寒；有的肌肉浮腫，是因土臟（脾）陽虛，不能制水；有的筋脈拘攣疼痛，是因木臟（肝）陽虛，不能滋養筋脈；有的虛寒咳嗽氣喘，身涼自汗，是因金臟（肺）陽虛，不能保護肺氣；有的遺精出血，大小便失禁，腰脊如斷，骨痛劇烈，是因水臟（腎）陽虛，精髓枯竭。這些症狀，有的是陰強反克，有的是元氣受損，都是陽不足以勝陰，病在陰中之火。
王太僕說：「寒證用寒藥無效，責其無水；熱證用熱藥無效，責其無火。」無火無水，問題都在命門，總稱為陰虛之病，不可不察。
所謂真陰的治療，凡是混亂必有起因，疾病必有根源，因此治病必須求本。五臟的根本在命門，神氣的根本在元精，這就是真陰的意義。王太僕說：「壯水之主，以制陽光；益火之源，以消陰翳。」正是此意。許學士說：「補脾不如補腎。」也是這個道理。近代只有我明朝的薛立齋深得其妙，常用仲景的八味丸（即益火之劑）和錢氏的六味丸（即壯水之劑），救人無數，效果顯著，確實很好。但真陰既虛，就不宜再洩，這兩方都用了茯苓、澤瀉，滲利過度，即使是仲景的《金匱》，也是為利水而設，雖說在大補之中加入無妨，但難免減弱補益之力，使療效難以顯現。