1氣穴
）熱輸五十九穴，水輸五十七穴，頭上五行行五，五五二十五穴，中侶兩旁旁五，凡十穴，大杼上兩旁各一，凡二穴，（平按：《素問》大杼作大椎，王注未詳，新校正云：按大椎上旁無穴，大椎下旁穴名大杼。）目瞳子浮白二穴，兩髀厭中二穴，（平按：《素問》厭下有分字。
）犢鼻二穴，耳中多所聞二穴，眉本二穴，完骨二穴，項中央一穴，枕骨二穴，上關二穴，大迎二穴，下關二穴，天桂二穴，巨虛上下四穴，（平按：四穴上《素問》有廉字。）曲牙二穴，天突一穴，天府二穴，天牖二穴，扶突二穴，天窗二穴，肩解二穴，關元一穴，委陽二穴，肩貞二穴，肩髃二穴，（平按：《素問》肩髃作喑門。）齊一穴，肓輸二穴，（平按：《素問》肓輸作胸俞，二穴作十二穴。
）背輸二穴，膺輸二穴，（平按：《素問》二穴作十二穴。）分肉二穴，踝上橫骨二穴，（平按：《素問》無骨字。）陰陽喬四穴，凡三百六十五穴，針之所由行也。（以上九十九穴，通療諸病也。平按：《素問》「凡三百六十五穴針之所由行也」十三字，在「天府下五寸」之下。
）水輸在諸分，熱輸在氣穴，寒輸在兩骸厭中二穴，（以上言三種輸穴之所在。骸，核皆反，骨也。別本為骩，於靡反，骨端曲兒也。平按：《素問》寒下有熱字。）大禁二十五，在天府下五寸。（三百六十五穴中，有大禁者，五里穴也，在臂天府以下五寸，五五二十五往瀉此穴氣，氣盡而死，故為大禁也。）
問曰：少陰何以主腎？腎何以主水？（問少陰之脈主之所由也。）答曰：腎者至陰也，（至，極也。腎者，陰之極也。）陰者盛水也，（陰氣舍水，故曰盛水。平按：《素問》、《甲乙》陰上有至字。）腎者少陰，少陰者冬脈也，（一曰肺者，量為不然也。少陰亦盛也，少陰之脈盛，屬於冬分也。
平按：《素問》、《甲乙》腎者少陰作肺者太陰也。）故其本在腎，其末在肺，皆積水也。（腎脈少陰，上入肺中，故曰末在肺也。所以腎之與肺，母子上下俱積水也。）問曰：腎何以能聚水而生病？（腎為至陰聚水，未知何由生病？）答曰：腎者胃之關閉，關閉不利，故聚水而從其類，上下溢於皮膚，故為胕腫。（胃主水穀，胃氣關閉不利，腎因聚水，肺氣之應，溢於皮膚，故為胕腫。
胕，扶府反，與腐同義也。平按：《素問》、《甲乙》胃之關閉作胃之關也，關閉不利作關門不利，胕腫下有「肘腫者聚水而生病也」九字。）問曰：諸水皆生於腎乎？答曰：腎者牝臟也，地氣上者，屬於腎而生水液，故曰至。（牝，陰也。地氣，陰氣也。陰氣盛水，上屬於腎，生於津液也，故以腎為極陰也。
氣穴
治療熱症的穴位有五十九個，治療水症的穴位有五十七個。頭上有五行，每行五穴，共二十五穴。脊椎兩旁各有五穴，共十穴。大杼穴上方兩側各有一穴，共二穴。
眼睛瞳子髎和浮白穴各二穴，兩側髀樞（髖關節）中各二穴。犢鼻穴二穴，耳中的聽宮穴二穴，眉根部的攢竹穴二穴，完骨穴二穴，後頸中央的風府穴一穴，枕骨上的玉枕穴二穴，上關穴二穴，大迎穴二穴，下關穴二穴，天柱穴二穴，巨虛上下廉共四穴。
曲牙（頰車）穴二穴，天突穴一穴，天府穴二穴，天牖穴二穴，扶突穴二穴，天窗穴二穴，肩解（肩井）穴二穴，關元穴一穴，委陽穴二穴，肩貞穴二穴，肩髃穴二穴。
臍中（神闕）穴一穴，肓俞穴二穴，背俞穴二穴，膺俞穴二穴，分肉穴二穴，踝上橫骨（解谿）穴二穴，陰蹻、陽蹻共四穴。總計三百六十五穴，是針灸治療的關鍵所在。
水症相關穴位分布於肌肉間隙，熱症相關穴位在氣穴，寒症相關穴位在兩側膝關節凹陷處。
特別禁忌的穴位有五里穴，位於天府穴下五寸，若誤瀉此穴二十五次，會導致氣盡而亡，故為大禁。
問： 少陰經為何主腎？腎為何主水？
答： 腎是至陰之臟，陰氣盛則主水。腎屬少陰，少陰對應冬脈，故其根本在腎，而影響可達肺，兩者皆與水液代謝相關。
問： 腎為何能積水而致病？
答： 腎是胃的關口，若關口不利，水液積聚，與腎同類相應，泛溢皮膚，形成浮腫。
問： 所有水症皆源於腎嗎？
答： 腎為陰臟，地氣（陰氣）上升歸於腎而生水液，故稱至陰。