天地之道，生一氣而判清濁，而清者輕而上升為天，濁者重而下降為地。天為陽，地為陰，乃為二儀。
陰陽之氣，各分三品，多寡不同，故有三陰三陽之六氣。然天非純陽，而亦有三陰，地非純陰，而亦有三陽，故天地各有三陰三陽，總之以十二矣。
然天之陰陽者，寒暑燥濕風火也，地之陰陽者，木火土金水火也。金火不同其運，是故五行彰矣。然天地氣運，升降不以，陰陽相感，化生萬物矣。其在天則氣結成象，以為日月星辰也，在地則氣化為形，以生人為萬物也。
然人為萬物之靈也，非天垂象，而莫能測矣。其我機理，歸自然也，其非聖意，而宣悟玄玄之理。故有祖聖伏犧占天望氣，及視龍馬靈龜，察其形象，而密解玄機，無不符其天理。乃以始為文字畫卦，造六甲曆紀命曰《太始天元冊文》，垂示之於後人也。以誚神農，昭明其道，乃始令人食谷，以嘗百藥，而制《本草》矣。
然後黃帝命其岐伯及鬼臾區，以發明太古靈文，宣陳造化之理，論其疾苦，以著《內經》焉。
凡此三皇三經，命曰三墳，通為教之本始，為萬法宗源，誠為天之候也。若論愈病疾，濟苦保命防危，非斯聖典，則安得致之矣。然經之所論，玄機奧妙，旨趣幽深，習者卒無所悟，而悟得其意者鮮矣。完素愚誠，輒考聖經，撮其樞要，積而歲久，集就斯文，以分三卷，敘為九篇，勒成一部，乃號《內經運氣要旨論》爾。乃以設圖彰奧，綺貫紀倜，襲句注辭，而敷其言意。
或可類推者，以例傍通，例成而陳精粹之文。詁訓難明者，兼義釋字音，以附之於後。雖言詞鄙陋，所乘從俗，而庶覽者曷為悟古聖之妙道矣。
河間劉守真謹序
《自序》
天地運行的法則，由一團元氣分化出清濁二氣：清氣輕揚上升成為天，濁氣沈濁下降化為地。天屬陽，地屬陰，這便是兩儀的形成。
陰陽之氣又各自分為三種層次，因含量多寡不同，故有三陰三陽共六種氣象。但天並非純陽，其中也包含三陰；地亦非純陰，其中蘊藏三陽，因此天地合計共有十二種陰陽氣象。
天的陰陽表現為寒、暑、燥、濕、風、火六氣；地的陰陽則顯現為木、火、土、金、水五行的循環。其中金與火的運行方式迥異，因而彰顯出五行特性。天地氣運升降交錯，陰陽相互感應，於是化育萬物——在天形成日月星辰的氣象，在地則凝結為有形生命，人類便是萬物中最具靈性的存在。
人類雖為萬物之靈，若不觀測天象啟示，便難以參透奧秘。人體機制本乎自然，若非聖人指點，無法領悟玄妙之理。上古聖王伏羲觀測天象雲氣，審視龍馬靈龜的紋理，暗中破解天機，無不吻合自然法則。於是創製文字與八卦，制定六甲曆法，編纂《太始天元冊文》傳承後世。繼而神農氏承此大道，教導百姓耕作食穀，親嘗百草編撰《本草》。
後有黃帝指派岐伯與鬼臾區，闡釋遠古靈文，揭示造化原理，探討疾病根源，遂成《內經》巨著。
這三部經典合稱「三墳」，是醫道根本、萬法源頭，實為天地運行的真實寫照。若要治病救命、防危濟苦，捨此聖典別無他途。然經典所述玄奧深邃，學習者多難領會，能真正悟透者稀少。我劉完素資質愚鈍，仍虔心研讀聖典，摘錄精要，經年累月編纂此書，分三卷九篇，命名《內經運氣要旨論》。書中繪製圖解闡明奧義，系統整理條目，詳加註釋闡發經義。
對可類推的理論，以範例輔助理解；遇文辭艱澀處，則附加字義注音。雖文風淺白隨俗，但求讀者能藉此領略古聖先賢的妙諦。
河間 劉守真 謹序