1卷之六
合下三卷，計論七篇，皆名大論。論五運六氣司天在泉，天時民病寒熱勝復之理。天地之陰陽四時，備於人身；人身之寒熱虛實，同於天地。首紀天元，而五運五行六氣微旨，歸於人氣以交變。更有五常之政，六元之紀，道極其大，理悉其微，至真至要，皆大論也。
[卷之六]
這最後三卷共收錄七篇論述，均稱為"大論"。內容探討五運六氣、司天在泉的規律，以及天候變化與人體疾病寒熱盛衰的關聯。天地間的陰陽四時變化，完整對應人體運行；而人體的寒熱虛實狀態，也與天地規律相通。首篇記載天元理論，將五運五行六氣的精微原理，歸結於人體氣機交變。另包含五常政令、六元紀年等論述，道理極其宏大，分析極其精微，至真至要，故皆以"大論"為名。
2天元紀大論第六十八篇
此篇引《天元玉冊》之言，以明五運六氣，上下相召，五六相合，三十歲為一紀，六十歲為一周，周而復始，無有終時，著之玉版，藏之金匱，署曰天元紀，故曰《天元紀大論》。
《太始天元玉冊·運氣微旨篇》曰：太虛寥廓，肇其化元，虛皇轉運，變易淵玄，萬物資始，五運終天，布氣真靈，總統坤元，十二流精，五氣橫天，曰陰曰陽，曰柔曰剛。寒暑燥濕風火。天之陰陽，天以三陰三陽上奉之。木火土金水，地之陰陽，地以生長化收藏下應之。天以陽生陰長，地以陽殺陰藏。
天有陰陽，地亦有陰陽。五運之德，氣建於寅。又曰，子午之歲，上見少陰；丑未之歲，上見太陰；寅申之歲，上見少陽；卯酉之歲，上見陽明；辰戌之歲，上見太陽；己亥之歲，上見厥陰。少陰所謂標也，厥陰所謂終也。厥陰之上，風氣主之；少陰之上，熱氣主之；太陰之上，濕氣主之；少陽之上，相火主之；陽明之上，燥氣主之，太陽之上，寒氣主之。所謂本也，是謂六元。
黃帝問曰：天有五行御五位，以生寒暑燥濕風。人有五臟化五
氣，以生喜怒思憂恐。論言五運相襲，而皆治之，終期之日，周而，復始，余已知之矣，願聞其與三陰三陽之候，奈何合之？
天有五行之理，以御天度之五位，而五位之中，以生寒暑燥濕風之五氣，數相合也。其在於人，則有五臟，化生五臟之氣，五氣之中，以生喜怒思憂恐之五志，其數亦相合也。《六節臟象大論》，言五運相襲，而皆治之，終期之日，周而復始，謂五運遞相承襲，而一歲之中，皆主治之，至三百六十五終期之日，則周而復始。
其運惟五，余已知之矣，願聞其與三陰三陽六氣之候，奈何合之？帝欲詳明五運六氣相合之道，而問也。
鬼臾區稽首再拜對曰：昭乎哉問也！夫五運陰陽者，天地之道也，萬物之綱紀，變化之父母，生殺之本始，神明之府也，可不通乎？
五運合於三陰三陽，蓋欲昭明天地交會之道，故曰昭乎哉問也。夫五運三陰三陽者，乃上天下地之道也。萬物之多，皆以五運陰陽為之綱紀。物極之變，物生之化，皆以五運陰陽為之父母。物之始生，物之肅殺，皆以五運陰陽，為之本始。是此五運陰陽，乃神明之府也，可不通乎？
故物生謂之化，物極謂之變。
《六微旨大論》曰：物之生，從乎化，物之極，由乎變，故物生謂之化，物極謂之變，此萬物所以有變化生殺也。
陰陽不測謂之神，神用無方謂之聖。
陰陽者，天地之道，至精至微，故陰陽不測謂之神，神用無方謂之聖，此天地神明之府，所當通其神用也。
夫變化之為用也，在天為玄，在人為道，在地為化。
即上文變化神用而推論之。夫變化之為用也，至神無方。故在天為玄，玄，純粹幽深也。在人為道，道，大中至正也。在地為化，化，孕育生成也。
天元紀大論第六十八篇
這篇文章引用《天元玉冊》的內容，闡明五運六氣的規律，上下相互呼應，五運與六氣相互配合，三十年為一紀，六十年為一周，循環往復，永無止境。這些道理被刻在玉版上，收藏於金匱之中，題名為「天元紀」，因此稱為《天元紀大論》。
《太始天元玉冊·運氣微旨篇》說：宇宙廣闊無邊，蘊含著變化的根源，虛空中的力量運轉不息，變化深奧玄妙，萬物由此而生，五運周流於天地之間，散布真靈之氣，統御大地的根本。十二時辰的精氣流轉，五氣橫貫天際，表現為陰陽、柔剛的變化。寒、暑、燥、濕、風、火，是天之陰陽，天以三陰三陽（太陽、少陽、陽明、太陰、少陰、厥陰）來對應。木、火、土、金、水，是地之陰陽，地以生長、化育、收斂、收藏來回應。天以陽氣促進生長，陰氣助長成熟；地以陽氣主肅殺，陰氣主藏斂。
天有陰陽，地也有陰陽。五運的特性，始於寅時。又說：子午之年，對應少陰；醜未之年，對應太陰；寅申之年，對應少陽；卯酉之年，對應陽明；辰戌之年，對應太陽；巳亥之年，對應厥陰。少陰是標，厥陰是終。厥陰之上，由風氣主導；少陰之上，由熱氣主導；太陰之上，由濕氣主導；少陽之上，由相火主導；陽明之上，由燥氣主導；太陽之上，由寒氣主導。這些是根本，稱為「六元」。
黃帝問道：天有五行統御五方，產生寒、暑、燥、濕、風五氣；人有五臟化生五氣，產生喜、怒、思、憂、恐五志。前人論述五運相承，循環不息，我已明白，但想請教五運如何與三陰三陽的氣候相配合？
天以五行之理，統御五方之位，五方之中產生寒、暑、燥、濕、風五氣，彼此相合。在人體則有五臟，化生五臟之氣，五氣之中產生喜、怒、思、憂、恐五志，同樣相互對應。《六節臟象大論》提到五運相承，循環不息，是指五運依次交替，一年之中各自主導，至三百六十五日完成一周，重新開始。
五運的道理我已瞭解，但想進一步知道五運如何與三陰三陽六氣配合？黃帝希望詳細理解五運與六氣相合的原理。
鬼臾區恭敬回答：您的問題非常深刻！五運與陰陽，是天地運行的法則，萬物的綱領，變化的根源，生殺的起始，也是神明的所在，怎能不深入探究？
五運與三陰三陽的配合，正是為了闡明天地交會的道理。五運陰陽，是天地運行的根本。萬物的繁盛，皆以五運陰陽為綱領；事物的極變與生滅，皆以五運陰陽為根源。因此，五運陰陽是神明的所在，必須通曉。
萬物初生稱為「化」，發展至極稱為「變」。陰陽變化莫測，稱為「神」；神的作用無所不在，稱為「聖」。
變化的作用，在天表現為玄妙，在人表現為道理，在地表現為化育。