原文
又諸腑者。皆陽也。清淨之處。今大腸小腸。胃與膀胱。皆受不淨。其意何也。然。諸腑者謂是。（清淨之處）非也。經言小腸者。受盛之腑也。大腸者。傳瀉行道之腑也。膽者。清淨之腑也。胃者。水穀之腑也。膀胱者。津液之腑也。一腑猶無兩名。故知非也。
又，諸腑都是陽，是清淨的地方。現在大腸、小腸、胃與膀胱，都接受不乾淨的東西，是什麼意思呢？是的，諸腑說的是這個。（清淨的地方）是不對的。經上說：小腸是受盛的腑，大腸是傳瀉行道的腑，膽是清淨的腑，胃是水穀的腑，膀胱是津液的腑。一個腑還沒有兩個名稱，所以知道不對。
原文
（小腸者心之腑大腸者肺之腑膽者肝之腑胃者脾之腑膀胱者腎之腑以上二十八字與後一節文異義同疑是舊注誤入正文者故今細書以別之）小腸謂赤（心色）腸。大腸謂白（肺色）腸。膽者謂青（肝色）腸。胃者謂黃（脾色）腸。膀胱者謂黑（腎色）腸。下焦之所治也。（一句總括）
（小腸是心的腑，大腸是肺的腑，膽是肝的腑，胃是脾的腑，膀胱是腎的腑。以上二十八個字與後一節文字不同但意義相同，懷疑是舊注誤入正文，所以現在用小字來區分。）小腸稱為赤（心色）腸，大腸稱為白（肺色）腸，膽稱為青（肝色）腸，胃稱為黃（脾色）腸，膀胱稱為黑（腎色）腸，是下焦所管理的。（這是一句總括。）
原文
此節採摘素問十二官論中六腑之職掌。以設難。而其所主。專在清淨二字。何者。素問既云膽者中正之腑。此難乃謂清靜之腑。審其所以為問答之意。則六腑皆可以為清淨之處。然舉各腑所掌言。一腑猶無兩名。而清淨之名。專歸諸膽。則十一臟取決於膽之謂邪。然則清淨之名。諸腑之所稟。而非獨膽也。然寓諸膽者。蓋有深意存焉。竊考六腑皆水穀之道路。而胃病則腸虛。腸滿則胃虛。其所常有者。唯谷與糟粕耳。何清淨之有。故膽獨統之。豈非諸腑取決於膽乎。是故不受水穀之濁穢。而盛清汁也。可以見已。小腸謂赤腸云云一節。實是古言。何以知之。五腑皆以腸名。故云爾。下焦之所治也一句。滑注以屬膀胱。非是。蓋自胃而下。皆以為下焦所治。故屬諸腑為可。
這一節摘取《素問·十二官論》中六腑的職掌，來設立問題。而其所著重，專在「清淨」二字。為什麼呢？《素問》既然說膽是中正之腑，此難卻說清靜之腑。仔細審察其問答的意思，那麼六腑都可以說是清淨的地方。但就各腑的職掌而言，一個腑還沒有兩個名稱，而清淨的名稱單單歸於膽，這難道不是十一臟取決於膽的意思嗎？然而清淨的名稱，是諸腑所稟受的，而不僅僅是膽啊。但寄託於膽，大概有深意存在。我私下考察六腑都是水穀的道路，而胃病則腸虛，腸滿則胃虛，它們所經常擁有的，只有穀物與糟粕罷了，哪裡有什麼清淨呢？所以膽單獨統領它，難道不是諸腑取決於膽嗎？因此不受水穀的濁穢，而容納清汁，由此可以看見了。小腸稱為赤腸等等這一節，實際上是古語。怎麼知道呢？五腑都以腸命名，所以這樣說。「下焦之所治也」一句，滑氏注釋認為屬於膀胱，不對。因為從胃以下，都認為是下焦所治理，所以屬於諸腑是可以的。
原文
（第三十七舊三十八）難曰。臟唯有五。腑獨有六者。何也。然。所以腑有六者。謂三焦也。有原氣之別（使）焉。主持諸氣。有名而無形。其經屬手少陰。此外腑（靈樞言孤腑同）也。故言腑有六焉。
（第三十七難，舊本第三十八難）問：臟只有五個，腑卻有六個，為什麼呢？答：之所以腑有六個，是因為有三焦。它有原氣的分別（功能），主持諸氣，有名稱而無形體，其經脈屬於手少陰。這是外腑（《靈樞》稱為孤腑，相同）。所以說腑有六個。
原文
按腑臟止有五者。五行之道為然。二五合為十者。生成之數是備。演而為六者。乃是六氣之應。配為十二。則支律之對。皆合天地自然之符焉。蓋三焦者。雖非正腑。然諸腑非藉其氣。則不能以為出納運化之用焉。唯其非正腑。故薰蒸肓膜之內。遊行腑臟之間。宛如外郭然。故謂外腑。靈樞謂之孤腑。亦與此義同。滑注三焦外有經而內無形。故曰外腑。非是。舊本第二十五篇。謂三焦心包。相為表裡。此篇則謂原氣之別焉者。彼以心包三焦為相火臟腑配合而言。此乃以命門三焦為本末而言。其義各異。此與下篇互相為義。順連讀。
按：臟腑只有五個，是五行之道如此。二五合為十，生成之數完備。推演為六，是六氣的對應。配為十二，則是地支與律呂的配合，都符合天地自然的符應。三焦雖然不是正腑，但諸腑如果不借助它的氣，就不能進行出納運化的功能。正因為它不是正腑，所以薰蒸於肓膜之內，遊行於臟腑之間，宛如外城一樣，所以稱為外腑。《靈樞》稱之為孤腑，也與此義相同。滑氏注說三焦外有經脈而內無形體，所以稱為外腑，不對。舊本第二十五篇說三焦與心包相為表裡，此篇則說它是原氣的分別。那是根據心包三焦為相火臟腑配合而言，此則以命門三焦為本末而言，其意義不同。此篇與下篇互相為義，應順連閱讀。
原文
（第三十八舊三十九）難曰。經言腑有五。臟有六者。何也。然。六腑者。正（張本作止）有五腑也。（除去三焦）五臟亦有六臟者。謂腎有兩臟也。其左為腎。右為命門。命門者。精神之所舍也。男子以藏精。女子以系胞。其氣與腎通。
（第三十八難，舊本第三十九難）問：經上說腑有五個，臟有六個，為什麼呢？答：六腑，正式（張本作「止」）有五腑（除去三焦）。五臟也有六臟，是說腎有兩臟，左邊是腎，右邊是命門。命門是精神所居住的地方，男子用來儲藏精氣，女子用來維繫胞宮，其氣與腎相通。
原文
（前篇有原氣所繫一句而無此句義互相發）故曰臟有六也。腑有五者。何也。然五臟各一腑。（有形）三焦亦是一腑。（無形）然不屬於五臟。（獨屬心包亦無形）故言腑有五焉。
（前篇有「原氣所繫」一句而無此句，意義互相發揮）所以說臟有六個。腑有五個，是什麼意思呢？答：五臟各有一個腑（有形），三焦也是一個腑（無形），但不屬於五臟（唯獨屬於心包，也是無形），所以說腑有五個。
原文
按五行之氣。唯大有二。君相是也。內經分心與包絡以為六臟。此篇則以腎有兩枚。岐為二臟。左腎與命門是也。後人誤認此難。遂為三焦命門表裡之說。余謂三焦既配心包以為表裡。已見第二十五難。此則示命門三焦有本末之理。兼發內經未發之旨。何者。五臟中唯心與腎抗對。無有軒輊。心包為二。則腎亦有此象。豈唯臟有兩形乎。蓋以陰中有陽。故乃有為二臟理。命門之義。詳見第三十四篇。
按：五行之氣，唯有火有二，君火與相火就是。《內經》區分心與心包絡作為六臟，此篇則以腎有兩枚，區分為二臟，左腎與命門就是了。後人錯誤地理解此難，於是產生三焦與命門表裡的說法。我認為三焦既然配合心包作為表裡，已見於第二十五難，此篇則顯示命門與三焦有本末的關係，同時闡發《內經》未發的旨意。為什麼呢？五臟中只有心與腎相對，沒有高低之分。心包為二，則腎也有此象。難道只是臟有兩形嗎？因為陰中有陽，所以有成為二臟的道理。命門的意義，詳見第三十四篇。
原文
（第三十九舊三十一）難曰。三焦者。何稟何生。何始何終。其（主）治常在何許。可曉以不。然。三焦者。水穀之道路。
（第三十九難，舊本第三十一難）問：三焦，稟受什麼？如何生成？從哪裡開始？到哪裡終止？它的（主要）治理常在什麼地方？可以知道嗎？答：三焦，是水穀的道路。
原文
（其氣屬諸腑）氣（腎間原氣）之所終始也。上焦者。在心下下鬲。（髃𩨗而上為胸部）在胃上口。（賁門）主內而不出。（飲食自咽入胃不妄出）其治在膻中。
（其氣屬於諸腑）是氣（腎間原氣）的終始。上焦，在心下，下膈，（髃𩨗而上為胸部）在胃上口（賁門），主管納入而不輸出（飲食從咽入胃，不妄出），其治理在膻中。
原文
（玉堂下一寸六分直兩乳間陷者是十四字疑是古來注語誤入正文中者故細書以別之且膻中本處名總稱兩乳間豈拘任脈一穴乎）中焦者。在胃中脘。（腹部中央）不上不下。（飲食蓄積）主腐熟水穀。其治在臍旁。（總臍左右諸穴）下焦者。當膀胱上口。（小腹）主分別清濁。（二便）以傳道。
（「玉堂下一寸六分直兩乳間陷者」是十四字，懷疑是自古以來的注語誤入正文中，所以用小字來區別。而且膻中本是處所的名稱，總稱兩乳間，豈能局限於任脈的一個穴位呢？）中焦，在胃中脘（腹部中央），不上不下（飲食蓄積），主管腐熟水穀，其治理在臍旁（總臍左右諸穴）。下焦，正對膀胱上口（小腹），主管分別清濁（二便），以傳導。
原文
（三字舊本誤在出而不入之下今移此）主出而不內也。（二便快通不秘澀）其治在齊下。
（「三字」舊本誤在「出而不入」之下，現在移到這裡）主管輸出而不納入（二便快通，不秘澀），其治理在臍下。
原文
（總小腹諸經穴舊本有一寸二字亦疑注語）故名曰三焦。其腑（氣府）在氣街。
（總小腹諸經穴，舊本有「一寸」二字，也懷疑是注語）所以稱為三焦。其腑（氣府）在氣街。
原文
（言十二經皆以俞為原則手足俞原亦為三焦主治之穴可知也）
（說十二經都以俞穴為原則，手足的俞穴、原穴也是三焦主治的穴位，可以知道。）
原文
按內經言三焦者多端。或由宗營衛之所化而言之。或緣內外經脈之所屬而言之。又或連膀胱言之。及言其理之橫直厚薄者。率皆因其有名而無形故也。蓋此篇雖發問於稟生始終。然其所主專在位與治。蓋飲食常憑其氣。而出入運化。以養生氣之原。故云水穀之道路。氣之所終始也。上焦之主內而不出者。此其職也。失職則噎鬲胸滿。隨時便生。中焦之不上不下者。輾磨水穀。此其職也。失職則翻胃腹脹痞積。往往而成。下焦之出而不納者。泌水液。轉糟粕。此其職也。失職則癃閉秘結溺數瀉痢等證。立而蜂起。故其為主治也。膻中齊旁及齊下。是由其位為治矣。然三焦之治。豈止三處乎。故下文云。其府在氣街。所謂氣街者。三焦之所行。諸十二經之俞原是也。靈樞衛氣篇曰。知六腑之氣街者。能知解結契紹於門戶。又曰。胸氣有街。腹氣有街。頭氣有街。脛氣有街。又動輸篇曰。四末陰陽之會者。此氣之大絡也。四街者。氣之徑路也。滑注以足陽明經有氣街穴。故疑為衍文。坐不深察故爾。其府在氣街一句。非誤非衍。所謂府者。指氣腑言。即氣穴是也。素問有氣府一篇。可以徵已。明吳文炳辨真云。氣街足陽明之氣衝。是亦一義也。
按：《內經》談到三焦的內容很多。有的從宗氣、營氣、衛氣所化生來說，有的從內外經脈所屬來說，又有連膀胱來說的，以及說到它的橫直厚薄等，大都是因為它有名稱而無形體的緣故。此篇雖然就稟受生成始終發問，但其所著重專在部位與治理。因為飲食常憑藉其氣，而出入運化，以滋養生氣之原，所以說「水穀之道路，氣之所終始也」。上焦主管納入而不輸出，這是它的職責；失職則噎膈、胸滿，隨時發生。中焦不上不下，輾磨水穀，這是它的職責；失職則翻胃、腹脹、痞積，往往形成。下焦輸出而不納入，泌別水液，轉輸糟粕，這是它的職責；失職則癃閉、秘結、尿頻、泄痢等證，立刻蜂起。所以它的治理，在膻中、臍旁及臍下，這是根據部位來治理。然而三焦的治理，豈止三處呢？所以下文說「其腑在氣街」。所謂氣街，就是三焦所運行，諸十二經的俞穴、原穴就是。《靈樞·衛氣篇》說：「知六腑之氣街者，能知解結契紹於門戶。」又說：「胸氣有街，腹氣有街，頭氣有街，脛氣有街。」又《動輸篇》說：「四末陰陽之會者，此氣之大絡也。四街者，氣之徑路也。」滑氏注釋認為足陽明經有氣街穴，所以懷疑是衍文。這是因為沒有深入考察的緣故。「其腑在氣街」一句，既非錯誤也非衍文。所謂「腑」，是指氣腑而言，即氣穴就是。《素問》有《氣府》一篇，可以證明。明代吳文炳《辨真》說：「氣街是足陽明的氣衝。」這也是其中一種意義。
原文
（第四十舊三十七）難曰。五臟之氣。於何發起。通於何許。可曉以不。然。五臟者。
（第四十難，舊本第三十七難）問：五臟之氣，從哪裡發起，通到哪裡？可以知道嗎？答：五臟者，
原文
當（靈樞作常）上關（靈樞作閱）於九（靈樞作七為是）竅也。故肺氣通於鼻。
應當（《靈樞》作「常」）上關（《靈樞》作「閱」）於九（《靈樞》作「七」為是）竅。所以肺氣通於鼻。
原文
鼻和（即肺氣和）則知香臭（腥焦臊腐）矣。肝氣通於目。目和（肝和）則知黑白（赤黃青）矣。脾氣通於口。口和（脾和）則知穀味（稻麥豆黍稷）矣。心氣通於舌。舌和（心和）則知五味（辛酸甘苦鹹）矣。腎氣通於耳。耳和（腎和）則知五音（宮商角徵羽）矣。五臟不和。則九竅（各有所主之竅如上所言）不通。六腑不和。則留結為癰。（統言形體所發諸腫）邪在六腑。則陽（經）脈不和。陽脈不和。則氣（邪氣）留之。氣留之。則陽脈（動）盛（實）矣。邪在五臟。則陰（經）脈不和。陰脈不和。則血（瘀血）留之。血留之。則陰脈（動）盛（實）矣。陰（邪）氣太盛。則陽（正）氣不得相營也。故曰格。（靈樞作關）陽（邪）氣太盛。則陰（正）氣不得相營也。故曰關。（靈樞作格）陰（邪）陽（邪）俱盛。不得相營也。故曰關（孤陰）格。（獨陽）關格者。不得盡其命而死矣。經言（脈度篇末說）氣獨行於五臟。不營於六腑者。何也。然。夫氣之所行也。如水之流。不得息也。故陰（經）脈營於五臟。陽（經）脈營於六腑。如環無端。莫知其紀。終而復始。其不復溢。人（疑血字誤）氣內溫於臟腑。外濡於腠理。
鼻氣調和（即肺氣和）就能知道香臭（腥、焦、臊、腐）。肝氣通於目，目氣調和（肝氣和）就能知道黑白（赤、黃、青）。脾氣通於口，口氣調和（脾氣和）就能知道穀味（稻、麥、豆、黍、稷）。心氣通於舌，舌氣調和（心氣和）就能知道五味（辛、酸、甘、苦、鹹）。腎氣通於耳，耳氣調和（腎氣和）就能知道五音（宮、商、角、徵、羽）。五臟不和，則九竅（各有所主之竅，如上所說）不通。六腑不和，則留結為癰（統指形體所發的各種腫）。邪在六腑，則陽（經）脈不和；陽脈不和，則氣（邪氣）留滯；氣留滯，則陽脈（動）盛（實）。邪在五臟，則陰（經）脈不和；陰脈不和，則血（瘀血）留滯；血留滯，則陰脈（動）盛（實）。陰（邪）氣太盛，則陽（正）氣不能與之相營運，所以叫做「格」（《靈樞》作「關」）。陽（邪）氣太盛，則陰（正）氣不能與之相營運，所以叫做「關」（《靈樞》作「格」）。陰（邪）氣、陽（邪）氣俱盛，不能相營運，所以叫做「關（孤陰）、格（獨陽）」。關格的患者，不能盡其天命而死。經上（《脈度篇》末說）說「氣獨行於五臟，不營於六腑」，這是為什麼呢？答：氣的運行，如同水的流動，不能停止。所以陰（經）脈營運於五臟，陽（經）脈營運於六腑，如環無端，沒有終止，終而復始。它不復溢，人（疑為「血」字之誤）氣內溫於臟腑，外濡於腠理。
原文
按此與脈度篇文。大同小異。五臟者。內藏神氣。而外閱九竅。故多無形之病。六腑者。傳穀物而外養肌肉。故多有形之病。謂在臟九竅不通。在腑留結為癰。可見形之與神。病各有則焉。凡臟皆屬陰。而其精上達為常。腑俱屬陽。而其氣下行為常。若有所不和。則氣血之分。偏虛偏實。至其太盛。則遂為關格之變。格是腑。將失常而反上逆。使所受水穀。格拒噎塞。關是臟既廢職。精氣下墜。故二便閉而不通。蓋下文復溢二字。即為死脈之名。則其所謂關格者。孤陰獨陽之病。殊無迴旋之生意者必矣。讀者莫以與靈樞文相顛倒為疑焉。
按：此節與《脈度篇》文大同小異。五臟內藏神氣，而外通九竅，所以多無形之病；六腑傳輸穀物而外養肌肉，所以多有形之病。所謂在臟則九竅不通，在腑則留結為癰，可見形體與神氣，病各有其規律。凡臟都屬陰，其精氣上達為正常；腑都屬陽，其氣下行為正常。若有所不和，則氣血之分偏虛或偏實；至於太盛，則就成為關格的變證。格是腑將失常而反上逆，使所接受的水穀格拒噎塞；關是臟既廢職，精氣下墜，所以二便閉而不通。下文「復溢」二字，就是死脈的名稱。那麼所謂關格，是孤陰獨陽的病，絕無迴旋的生意是必然的。讀者不要因為與《靈樞》文字相顛倒而懷疑。
原文
（第四十一舊四十）難曰。經言肝主（五）色。心主（五）臭。脾主（五）味。肺主（五）聲。腎主（五）液。鼻者肺之候。（肺氣通臭）而反知香臭。（心所主）耳者腎之候。（腎氣通耳）而反聞聲。（肺所主）其意何也。然。肺者。西方金也。金生（育）於巳（位）巳者南方火。火者心。心主臭。故令鼻知香臭。腎者。北方水也。水生（育）於申（位）申者西方金。金者肺。肺主聲。故令耳聞聲。
（第四十一難，舊本第四十難）問：經上說肝主（五）色，心主（五）臭，脾主（五）味，肺主（五）聲，腎主（五）液。鼻是肺的官竅（肺氣通於臭），反而能知香臭（心所主）；耳是腎的官竅（腎氣通於耳），反而能聽聲音（肺所主）。這是什麼意思呢？答：肺屬西方金，金生（育）於巳（位），巳屬南方火，火對應心，心主臭，所以使鼻知香臭。腎屬北方水，水生（育）於申（位），申屬西方金，金對應肺，肺主聲，所以使耳能聽聲。
原文
按此承上引脈度篇文。而舉臟氣各有所通之竅。以發問難。所謂肝開竅於目。而其所主五色。亦通乎此。脾開竅於口。而其所主五味。亦從此而入。唯腎與心肺。其所主不應於其竅。所以發疑焉。大氐五行之道。有生克之分。又有胎化之理。此篇所述。即胎化之變也。何則。鼻知臭者相剋。耳聞聲者相生。故知非五行常例之謂。蓋金胎於東方木。而化於南方火。其氣旺於西。自卯至酉。金得有氣。水胎於南方陽中。而化於西方金。其氣旺於北。自午至子。水得有氣。火。木之胎化亦然。越人之意。所以使學者知人身五行生剋之外。別有胎化之理者。如此。六元正紀大論曰。春氣西行。夏氣北行。秋氣東行。冬氣南行。淮南子天門訓曰。金生丁巳。壯於酉。死於醜。三辰皆金也。水生丁申。壯於子。死於辰。三辰皆水也。是亦與此篇之義相類。
按：此節承接上面引用《脈度篇》文，而舉出臟氣各有相通的竅，來發問。所謂肝開竅於目，而其所主五色也通於此；脾開竅於口，而其所主五味也從此而入；只有腎與心肺，其所主不與其竅相應，所以產生疑問。大抵五行之道，有生克的分別，又有胎化的道理。此篇所述，就是胎化的變化。為什麼呢？鼻知臭是相剋，耳聞聲是相生，所以知道不是五行的常例。因為金胎育於東方木，而化於南方火，其氣旺盛於西方，從卯到酉，金得到氣；水胎育於南方陽中，而化於西方金，其氣旺盛於北方，從午到子，水得到氣。火、木的胎化也是這樣。越人的意思，是要使學者知道人身五行生剋之外，另有胎化的道理如此。《六元正紀大論》說：「春氣西行，夏氣北行，秋氣東行，冬氣南行。」《淮南子·天門訓》說：「金生於丁巳，壯於酉，死於醜，三辰都是金；水生於丁申，壯於子，死於辰，三辰都是水。」這也與此篇的意義相類似。
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